外资企业分支机构也称为分公司，外资独立核算分公司可以在分公司注册所在地开票并纳税。虽然独立核算的外资分公司不具备法人主体资格，但一样享受税收优惠政策。
以在上海注册的外资企业分公司为例，其可以享受上海高额的返税税收优惠政策(财政扶持)。独立核算分公司在上海开发区注册登记可以享受的税收优惠政策如下：
1、外资分公司营业税优惠政策
分公司所交纳的营业税，可以享受实际交税额的20-40%税收返还。
2、外资分公司企业所得税优惠政策
分公司交纳的企业所得税，可以享受实际交税额的10-18%税收返还。
3、外资分公司增值税优惠政策
分公司交纳的增值税，可以享受实际交税额的4-8%的税收返还。
4、上海税收优惠政策注意事项
（1）只有在上海的开发区内注册外资分公司，才可以享受返税优惠政策。
（2）上海各区或开发区返税比例、返税方式等方面存在很大的差异。上海返税最高的是崇明与金山，营业税可以返还35-40%，其次是奉贤、闵行、嘉定的开发区，营业税返20-30%左右。
（3）需特别注意返税用语。有些开发区或招商代理注册公司会玩文字游戏，说返还地方财政的50-80%，这个“地方”概念很模糊的，即可以指整个上海市地方财政，也可指分公司注册所在区、镇、开发区的地方财政。上海的税收是各级政府财政分成的，到开发区手里的税收并不是很多。那些代理公司或开发区所说的返地方财政的多少，其实是指开发区的税收留成，真正返到企业手中的税收很少。
